Resumo do manual 15:
Importe o arquivo SPED Contribuições através da rotina 2.1.1 (Importar Escrituração);
Acesse a rotina 2.7.3.2 e confira se as notas fiscais tem itens (C170), caso não tenha, importe os itens por meio da rotina 8.1;
Acesse a rotina 10.4.2 para analisar relatórios de comparação do SPED Fiscal x PIS/COFINS e verifique se existe alguma divergência entre os valores;
Acesse a rotina 10.4.1 caso seja encontrada alguma divergência no relatório de comparação apurado; acima. Através dessa rotina, será possível corrigir as divergências apontadas;
Acesse a rotina 2.7.1.3 - Apuração por CFOP - Essa rotina aponta relatórios relacionados aos CFOPs;
Abra a rotina 2.7.2.2 - Classificação dos Produtos com NCM de Acordo com a TIPI - A rotina analisa o CFOP e as suas descrições;
Após seguir os passos citados acima, abra a rotina 2.4.1 para realizar auditorias automáticas;
Após realizar as auditorias automáticas, acesse a rotina 2.4.2 para efetuar as correções automáticas no SPED Contribuições;
A rotina 2.7.4 oferece Conferências/Relatórios/Correções de Documentos Fiscais, o que permite realizar análises consistentes;
As rotinas da 2.6 tratam de cadastros e lançamentos e são muito importantes nesse processo. A rotina 2.6.7.1 é uma das mais utilizadas, pois é referente ao bloco M, apuração de PIS/COFINS, permitindo lançar ajustes;
Acesse os relatórios gerais da rotina 2.7 que são utilizados para conferência. A rotina 2.7.4 é uma das mais utilizadas, pois traz Conferência/Relatórios/Correções de Documentos Fiscais;
Acesse a rotina 2.4.4 - referente a Redução de ICMS da Base de Cálculo;
Por fim, acesse a rotina 2.2 e gere o SPED Contribuições.
Manual 15 completo:
Passo 1: Importar o arquivo SPED Contribuições entregue pelo cliente ou gerado pelo sistema de gestão da empresa através da rotina 2.1.1 (Importar Escrituração).
Dica: Confira com o seu sistema de gestão a possibilidade de gerar o SPED contribuições com itens. 
Passo 2: Verifique se os itens das notas de emissão propria estão informados por meio da rotina 2.7.3.2.
Caso o relatório retorne vazio continue no 4º Passo.
Passo 3: Caso o relatório retorne notas sem itens, utilize a rotina 8.1 para importação dos itens das notas de emissão própria. Vale lembrar que as informações do XML pode alterar as informações presente no SPED.
Passo 4: Compare os dados do SPED Fiscal e Contribuições através do cruzamento de informações utilizando a rotina 10.4.1.
É necessário o arquivo SPED fiscal da mesma competência importado para dentro do SAAM;
Esse cruzamento só ocorre com o arquivo SPED Fiscal importado na mesma base do SPED Contribuições, isto é, caso a empresa tenha a junção com outra filial o cruzamento não encontrará;
Para analisar as auditorias desse cruzamento, acesse a rotina 12.4.
Passo 5: Analise nosso relatório da rotina 2.7.1.3 - Apuração por CFOP, nele é possível classificado a apuração do Pis/Cofins agrupado por CFOP, CST e alíquota do seu arquivo SPED.
Imagem 3: Relatório 2.7.1.3 apuração Pis/Cofins
Quando o arquivo SPED Contribuições tem mais de uma empresa, indicamos utilizar a quarta opção.
Passo 6: Para analise de produtos com NCM, utilize a rotina 2.7.2.2 para a geração de um relatório classificando o produtos com NCM de acordo a TIPI.
Imagem 4: Relatório 2.7.2.2 - Classificação dos produtos com NCM de acordo com a TIPI
Passo 7: Audite todos os registro do arquivo SPED utilizando a rotina 2.4.1.
Imagem 5: Auditorias automáticas.
Analise as advertências do registros C170, existe alertas relevantes.
Passo 8: utilize a rotina 2.7.4 para realizar correções em lotes, conferência e elaborar relatórios personalizados. 2.7.4 - Conferência/Relatórios/Correções de Documentos Fiscais
Passo 9: Consulte dados nas principais rotinas do SPED Contribuições
2.6.1.1 - Reg. de Abertura do Arquivo (0000).
2.6.1.4 - Regime de Apuração (0110). 2.6.1.4 - Regime de Apuração (0110)
2.6.1.10 - Produtos e Serviços (0200).
2.6.1.15 - Composição das Receitas do Período (0900). 2.6.1.15 - Composição das Receitas do Período (0900)
2.6.2.2 - Notas de Prestação de Serviços (A100).
2.6.3.2 - Notas Fiscais (C100)
2.6.3.3 - Consolidação de NF-e - Vendas (C180)
2.6.4.2 - Notas Fiscais de Transporte (D100)
2.6.5.2 - Demais Doc. e Oper. Geradoras de Contribuição e Créditos (F100)
2.6.5.3 - Bens Incorp. ao Ativo Imob. - Créditos com Base em Depreciação/Amortização (F120)
2.6.7.1 - Apuração PIS/COFINS
Passo 10: Use as rotinas abaixo para gerar relatórios:
2.7.1.1 - Resumo da Apuração
2.7.1.2 - Apuração por CST
2.7.1.3 - Apuração por CFOP (Dica: Quarta opção) - Essa rotina aponta relatórios relacionados aos CFOPs
2.7.2.2 - Classificação dos Produtos com NCM de Acordo com a TIPI - A rotina analisa o CFOP e as suas descrições
2.4.1 - auditorias automáticas
2.4.2 - realizar correções automáticas
2.7.2.1 - Alíquotas e CST de PIS/COFINS na Entrada/Saída
2.7.4 - Conferência/Relatórios/Correções de Documentos Fiscais
Passo 11: Para efetuar a redução do ICMS da Base de Cálculo utilize a rotina 2.4.4.
Passo 12: Gere o SPED Contribuições na rotina 2.2 e valide no PVA.
Pronto agora você já tem um Sped Contribuições auditado!